
Постановщиком боевых сцен всей трилогии «Матрица» был китайский кинорежиссёр и хореограф Юэнь Ву Пин.

Художник-постановщик трилогии "Матрица" Саймон Уайтли рассказал, что в зеленом коде из японских иероглифов и цифр был зашифрован рецепт суши. По его словам, его он позаимствовал из поваренной книги своей жены-японки

Шону Коннери была предложена роль Морфеуса, однако он отказался, объяснив тем, что «совершенно ничего не понял в сценарии».

После удачной роли в фильме «Крадущийся тигр, затаившийся дракон» Мишель Йео была предложена роль Серафима (Сераф), но она отказалась из-за нестыковок в расписании. Впоследствии сценаристы «Матрицы» заменили образ Серафима мужским персонажем, и эту роль получил Коллин Чоу.

Судя по словам Морфеуса, Нео очнулся в XXII веке от Рождества Христова и все события произошли предположительно в то же время, а XX век давно уже кончился и существовал только в иллюзорном мире матрицы.

Первой программой подготовки Нео был рукопашный бой. В течение десяти часов Тэнк пичкает его мозг всеми видами боевых искусств.

Кроме Нео агента Смита в бою побеждал Сераф. Об этом упоминается в сцене, где Серафа и Сати настигает Смит:
— Привет, привет. Давненько не виделись…. Помню, сражаться с тобой также нелегко, как с духом.
— Я тебя уже побеждал.
— Да, ты прав, но сейчас, как видишь, несколько иная обстановка.

По словам Архитектора это шестая версия матрицы и у Нео было пять предшественников. И все они исполнили своё предназначение и перезагрузили матрицу.

В конце первой части Нео разрушает программный код Смита и последний превращается в вирус матрицы. Смит получает способность копировать себя, вставляя свой код в другие программы и разумы людей. Под конец он заразил всю матрицу и машинам пришлось заключать сделку с Нео чтоб с его помощью уничтожить вирус и вернуть матрицу.

Съёмки сцен с вертолетом чуть не привели к закрытию всего проекта, т.к. съёмочная группа нарушила сразу несколько законов, пролетев на вертолетах через закрытое для полетов воздушное пространство. Однако впоследствии законы были изменены, чтобы продолжились съёмки фильма.
